Relasi agama dan Negara merupakan isu yang krusial diperbincangkan beberapa tahun terakhir di Indonesia. Isu ini merupakan isu klasik yang telah diperbincangkan di dunia ilam pada abad pertengahan. Secara sosio historis ada tiga model relasi antara agama dan negara.
Indonesia merupakan negara yang memiliki berbagai ragam etnik, budaya dan agama. keaneekaragaman ini di satu sisi merupakan modal kultur dalam membangun identitas nasional yang unit, namun di sisi lain kenyataan pluralictis menjadi salah satu faktor penyebab munculnya berbagai konflik sosial di Indonesia.